A partir de 1998 se crearon programas de post grados, derivados de procesos investigativos: especialización de Sistema de Calidad y Auditoria en Servicios de Salud, aprobada por el  Ministerio de Educación Nacional (MEN) 00559 del nueve de enero de 2015- SNIES 8146,  Epidemiología, aprobada por Resolución del (MEN) 01484 del seis de febrero del 2014 – SNIES: 9465  y Gerencia en salud, aprobada por el (MEN) 21027 del 11 de diciembre del 2014 – SNIES 9468. De igual forma, surge la especialización de salud familiar aprobada mediante Resolución del (MEN) No.13100 del 06 de mayo de 1999 – SNIES 9467.